資源 » 技術(shù)資源中心 » 多肽資源中心 » 肽庫設(shè)計工具 » 重疊肽庫
主要用于全蛋白掃描,為篩選線性或連續(xù)性表位提供理想工具。根據(jù)目的蛋白或長肽設(shè)計關(guān)鍵短肽序列,可用來鑒定蛋白活性、免疫特異性以及抗體結(jié)合性。重疊肽庫的設(shè)計主要由肽鏈長度和步移(offset number)兩個參數(shù)決定,從目的蛋白N端逐步向C端截取設(shè)計,每次轉(zhuǎn)移一個或幾個氨基酸,序列之間有部分重合,最終形成重疊肽庫。
選擇合適的步移和肽段長度可以降低實驗成本,同時使數(shù)據(jù)價值最大化。步移通常設(shè)計為肽段長度的1/3。長肽段會包含更多的表位,但是一般這類肽段很難合成,并且?guī)熘邪碾亩巫兩佟6屉亩胃菀缀铣桑哺阋耍侩亩蔚谋砦惠^少。短步移數(shù)和短肽組合可以形成最多數(shù)量的多肽,而長步移數(shù)與長肽組合產(chǎn)生的多肽數(shù)量最少。
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