多克隆抗體是多種免疫球蛋白的集合，每種免疫球蛋白由不同的B細胞克隆產生。這些抗體會瞄準單個抗原上的不同表位或結合位點。多克隆抗體由多個B細胞克隆產生，隨后靶向多個表位，這就是多克隆抗體與單克隆抗體的區別所在。
所有抗體的生成，無論是多克隆抗體還是單克隆抗體，均始于激發免疫反應，即所謂的免疫。預期目標被注射到宿主體內，被免疫系統識別為外來物，并被抗體靶向進行免疫阻斷或清除。未能誘發免疫應答時還需要使用佐劑，即免疫原性物質如費氏佐劑或鑰孔血藍蛋白（KLH）來進一步推動免疫招募。免疫是多克隆制備的重要環節。典型的免疫應答概述如下。
初次免疫應答
抗原和適當的添加佐劑與宿主的初始暴露又被稱為“初次”免疫。典型的免疫注射方法包括皮膚注射、腹膜注射、皮下注射或肌肉注射。不常見的替代方法還有口服和鼻內給藥。DNA免疫也是一種新興技術，可用于毒性抗原或其他難以生產的抗原。任何后續的抗原暴露則稱為“加強”免疫。
通過抗原提呈細胞進行抗原加工
巨噬細胞、樹突細胞（DC）以及少量B細胞等所有抗原提呈細胞（APC）會通過內吞作用或吞噬作用將抗原內化。抗原加工將抗原斷裂呈更小的片段，然后將這些片段轉移到APC的表面。
B細胞的刺激
輔助T細胞識別APC表面的抗原后會釋放刺激信號分子--細胞因子。這些細胞因子會激活B細胞，而B細胞同樣會通過其B細胞受體（BCR）識別出抗原。有些B細胞在BCR與抗原相互作用后不需要輔助T細胞的激活，通常會產生較快的免疫反應，并產生親和力較低的抗體。輔助T細胞的參與對完整的免疫反應和調節自身耐受性至關重要。
B細胞增殖和抗體分泌
活化的B細胞分裂后形成記憶B細胞和血漿細胞群。這兩種類型的細胞都能識別相同的抗原表位。血漿細胞將抗體分泌到血清內用以進行免疫識別，而記憶B細胞則持續較長時間，對二次接觸相同抗原做出快速反應。
在免疫過程中，需要測量抗體水平以評估免疫進展。對比免疫后的血清樣品與免疫前的血清樣品開展針對靶抗原的ELISA測定，從中揭示免疫所觸發的免疫應答程度。通過樣品連續稀釋來決定抗體的滴度。以1:64,000的滴度視為免疫應答合格基準，然后進入血清采集或淋巴細胞融合緩解。滴度較低的抗體可能需要后續的加強免疫、其他給藥途徑或額外的佐劑。
多克隆抗體的生產只需從宿主動物體內采血，并將細胞部分與含有分泌抗體的血清部分分離。由于很多抗原特異性抗體都通過多種活化B細胞來分泌，而且血清含有多種不同抗體克隆產物，因此將其稱為多克隆抗體。具體而言，針對于一種抗原的多種克隆抗體的制備方式是將抗原加工成片段，而且每個片段含有更小的區域，即所謂的抗原表位。每一個表位都能被特定的BRC所識別。不同的B細胞群會分泌出特定的、但同樣針對于同一種抗原的不同抗體。此外，血清不僅含有專門針對意向靶點抗原的抗體，同時還存在針對于其他靶點、藥物、激素等的免疫球蛋白。血清可以直接用作分子生物學探針，但通常需要進一步的純化才能提高某一具體化驗測定的靈敏度和特異性。親和純化可實現不同程度的抗體回收，具體取決于以下所示的技術，但都達不到單克隆抗體的表位水平特異性。
| 親和純化技術 | 優點 | 缺點 |
|---|---|---|
| 蛋白質A/G | 簡單，高性價比 | 回收所有免疫球蛋白 |
| 抗原特異性 | 僅回收抗原特異性抗體 | 需要使用非微量抗原 |
| 應用 | 使用多克隆抗體的理由依據 |
|---|---|
| ELISA檢測抗體（直接、間接、夾心和捕獲ELISA法） | 結合多個抗原表位以交付多種檢測分子。 |
| ELISA捕獲抗體 | 多反應性可以最大限度地從樣品中回收抗原。 |
| 蛋白質印跡檢測抗體 | 多表位識別可以實現抗原改變（變性/線性化） |
| 治療性抗體藥物 | 通過大量抗體來識別靶點，以實現最大化的藥物輸送、免疫招募、封閉或活化。 |
| 臨床試驗 | 可潛在提升檢測能力。 |
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