細胞（雜交瘤細胞、B細胞、單個B細胞）
| 服務包 | 交付周期 Updated (從開始) |
默認交付 | 可選交付 | |
|---|---|---|---|---|
| Sanger測序 | 抗體可變區(qū) | 10個工作日 |
測序報告包括：
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| 全長抗體 | 12個工作日 | |||
| NGS測序 | 高通量測序 | 10個工作日 |
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注：
a) 樣品要求：
數量：>1×106個細胞; 物種： 人，小鼠，大鼠，兔，雪貂等。
b) 附加服務：1. 高通量重組抗體表達服務 2. 大規(guī)?？贵w生產服務 3. 抗原抗體結合確認。
目標：開發(fā)4-1BB特異性抗體
免疫：4-1BB胞外區(qū)
結果：獲得了107株4-1BB抗體，并使用高通量NGS抗體測序平臺分析了基因組信息
1. 系統(tǒng)進化樹分析-VH區(qū)
在 107 個克隆中，有 5 個克隆顯示出與其他克隆相同的V區(qū)。
2. 系統(tǒng)進化樹分析-VL區(qū)
在107個克隆抗體中，有6個克隆與其他克隆顯示相同的V區(qū)。
3. Germline分析（表明抗體多樣性）
4. CDR長度分析（表明候選抗體）
1. 保存抗體多樣性： 雜交瘤測序直接對雜交瘤細胞產生的抗體進行測序，這保留了抗體的多樣性。相反，從頭抗體測序依賴于分離單個抗體，并且可能無法捕獲免疫應答中存在的全部多樣性。
2.時間和成本效率： 與從頭抗體測序相比，雜交瘤細胞測序是一種更具時間和成本效益的方法。
3. 質量控制和確認: 由于序列是從雜交瘤細胞本身獲得，因此可以確保該抗體確實是由雜交瘤細胞產生。在從頭測序中，需要額外的驗證步驟來確認獲得序列的真實性。
4. 與已確定的雜交瘤系的相容性: 雜交瘤細胞系具有明確的追溯歷史，已知的特性和可追溯的文件，為抗體測序提供大量的信息，有助于進一步表征和開發(fā)。
5. 區(qū)分某些氨基酸： 蛋白質測序在區(qū)分特定氨基酸（如亮氨酸和異亮氨酸）時會遇到挑戰(zhàn)，這可能導致在最終序列中引入錯誤。相反，雜交瘤測序直接對抗體產生細胞的cDNA進行測序，消除了潛在問題，并產生更精確、準確和可靠的結果。
1. 研究目標：如果您需要測定抗體的完整編碼序列（其中包括可變區(qū)和恒定區(qū)），可使用Sanger測序法。然而，如果您需要對抗體庫進行全面分析，包括克隆多樣性和罕見或低豐度變異體的鑒別，NGS可以提供更全面的描述。
2.樣品數量：評估需要測序的樣品數量。Sanger測序法繁瑣且成本較高，適用于少量樣品。另一方面，NGS測序平臺提供更高的通量，使得能夠同時對大量樣品進行測序。
3. 成本考慮：評估您的預算和資源。通常使用Sanger測序法，對小規(guī)模項目或對有限數量的樣品進行測序時更具成本效益。由于文庫準備、測序和數據分析相關的前期成本較高，NGS可能更昂貴。但是，對于大規(guī)模項目或測序樣品較多時，NGS更具成本優(yōu)勢。
4. 序列準確度： 評估您的研究所需序列準確度水平。Sanger測序法長期以來以準確度高而聞名，特別是在獲得單個完整序列方面。NGS平臺的測序一般是準確的，但具有較高的誤差率，特別是在同聚物區(qū)域或重復序列方面。您需要考慮兩種方法中哪一種可以滿足項目的特定準確度要求。
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