服務(wù)內(nèi)容

Next-Generation Sequencing (NGS)

訂購(gòu)訊息

質(zhì)粒長(zhǎng)度 (bp)	價(jià)格	交付周期（工作日）
≤ 5kb	￥58	3
5-20kb	￥108
20-35kb	￥168
> 35kb	聯(lián)系我們

交付內(nèi)容

• excel 報(bào)告: 包含測(cè)序數(shù)據(jù)量、質(zhì)控結(jié)果、比對(duì)結(jié)果、變異結(jié)果
• pdf 報(bào)告：將excel中的關(guān)鍵結(jié)果、具體的變異位點(diǎn)以及質(zhì)粒測(cè)序深度模式圖整合生成該報(bào)告
• gbk 文件：由 pLannotate注釋生成包含質(zhì)粒中每個(gè)原件的GenBank 文件

* 聯(lián)系我們索取樣本報(bào)告

Oxford Nanopore Technologies (ONT)

訂購(gòu)訊息

質(zhì)粒長(zhǎng)度 (bp)	價(jià)格	交付周期（工作日）
2.5-25kb	￥140	2
25-125kb	￥280
125-300kb	￥560

交付內(nèi)容

• Nanopore_result.pdf: 原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制結(jié)果，參考序列的比對(duì)結(jié)果，和變異檢測(cè)結(jié)果
• Nanopore_result.xlsx: 原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制結(jié)果、變異檢測(cè)結(jié)果、每個(gè)位點(diǎn)的測(cè)序深度，和檢測(cè)到的堿基類(lèi)型的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)
• vars_pLann.gbk: 質(zhì)粒功能元素（由pLannotate注釋?zhuān)⒆儺悪z測(cè)結(jié)果（包括結(jié)構(gòu)變異）和參考序列組成
• pLann.html: 質(zhì)粒示意圖
• .final.fa : 重建的DNA序列用突變堿基替代參考序列中的堿基，只有具有高置信度且突變頻率大于60%的突變才用于替代
• NanoPlot-report.html: 由NanoPlot生成的原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制結(jié)果
• .fastq file: raw data: 聯(lián)系我們索取

* 聯(lián)系我們索取樣本報(bào)告

常見(jiàn)問(wèn)題解答 (FAQ)

• 1. 收樣標(biāo)準(zhǔn)？

  NGS收樣標(biāo)準(zhǔn)

  質(zhì)粒長(zhǎng)度 (bp)	濃度	容量
  ≤ 5kb	10 ng/μL	≥20 μL
  5-20kb
  20-35kb

  溶劑：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶劑中不能含有EDTA）
  濃度：	濃度必須采用Qubit，不能使用Nanodrop進(jìn)行檢測(cè)
  純度：	建議 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送測(cè)樣本必須是單克隆質(zhì)粒，若是混合物，可能會(huì)造成結(jié)果不準(zhǔn)確
  完整度：	建議采用瓊脂糖凝膠電泳對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行檢測(cè)，判斷是否存在降解情況，質(zhì)粒降解可能會(huì)造成測(cè)序失敗
  寄送方式：	干冰

  Nanopore收樣標(biāo)準(zhǔn)

  質(zhì)粒長(zhǎng)度 (bp)	濃度	容量
  ＜20 kb	30 ng/μL	≥10 μL
  20-100 kb	50 ng/μL	≥20 μL
  100-300 kb	50 ng/μL	≥40 μL

  溶劑：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶劑中不能含有EDTA）
  濃度：	濃度必須采用Qubit，不能使用Nanodrop進(jìn)行檢測(cè)
  純度：	建議 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送測(cè)樣本必須是單克隆質(zhì)粒，若是混合物，可能會(huì)造成結(jié)果不準(zhǔn)確
  完整度：	建議采用瓊脂糖凝膠電泳對(duì)質(zhì)粒進(jìn)行檢測(cè)，判斷是否存在降解情況，質(zhì)粒降解可能會(huì)造成測(cè)序失敗
  寄送方式：	干冰

• 2. 如何訂購(gòu)全質(zhì)粒測(cè)序服務(wù)？

  您可以將全質(zhì)粒測(cè)序服務(wù)與您的基因合成和質(zhì)粒制備項(xiàng)目捆綁，或者將樣本寄給我們。

• 3. 你是如何對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序的？

  在金斯瑞，我們采用先進(jìn)的測(cè)序技術(shù)和方法對(duì)您的質(zhì)粒樣本進(jìn)行測(cè)序。我們擁有全面的測(cè)序平臺(tái)（Sanger測(cè)序，NGS，Nanopore），可以為您的質(zhì)粒提供完整準(zhǔn)確的序列分析，無(wú)論您是否處理大質(zhì)粒或難以測(cè)序的區(qū)域，如ITR和GC-rich區(qū)域。

• 4. 為什么需要對(duì)質(zhì)粒全長(zhǎng)進(jìn)行測(cè)序?
  1. 驗(yàn)證序列完整性：質(zhì)粒在克隆或擴(kuò)增過(guò)程中可能會(huì)發(fā)生遺傳修飾，導(dǎo)致潛在的序列錯(cuò)誤或不希望的突變。
  2. 克隆和工程的質(zhì)量控制：測(cè)序質(zhì)粒作為質(zhì)量控制步驟，用于驗(yàn)證克隆插入物的準(zhǔn)確性，確認(rèn)不存在不需要的突變，并確保實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的完整性。
  3. 優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)：準(zhǔn)確了解質(zhì)粒序列使您能夠更有效地設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)。
• 5. 測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性如何?

  目前的堿基準(zhǔn)確性大于95%，并且可通過(guò)一致性序列進(jìn)行矯正，矯正后的準(zhǔn)確率可達(dá)99.9%。

• 6. 測(cè)序失敗的原因有哪些?

  所有序列未達(dá)到30xcoverage即說(shuō)明測(cè)序失敗，造成建庫(kù)失敗的主要原因有：未按照要求用Qubit檢測(cè)濃度，存在基因組和質(zhì)粒的片段，其它質(zhì)粒雜質(zhì)，存在質(zhì)粒降解的現(xiàn)象，所以建議客戶送樣前確定樣本是否達(dá)標(biāo)。

• 7. 您能否修復(fù)全質(zhì)粒測(cè)序中檢測(cè)到的突變？

  是的，通過(guò)使用GenScript的定點(diǎn)突變服務(wù)，您可以受益于我們的專(zhuān)業(yè)知識(shí)和簡(jiǎn)化流程，旨在提供快速的交付時(shí)間、節(jié)省成本，并在引入或修復(fù)突變時(shí)保持高準(zhǔn)確性。